若きジェダイ、アナキン・スカイウォーカーの成長と変化、戦いを描くサーガの第2章。惑星ナブーの戦いから10年後。パドメ・アミダラと彼女を護衛するアナキンは、互いに惹かれ合う。一方、銀河共和国は、ドゥークー伯爵により新たな脅威にさらされていく。そして、ある惑星で大量のクローンが製造されている光景を目にするオビ＝ワン・ケノービ。やがて、アナキンとパドメ、そしてオビ＝ワンはクローン戦争に引き込まれていく。