C.E.73。プラント「アーモリーワン」で、オーブの代表首長となったカガリとプラント最高評議会議長デュランダルとの極秘会談が行われようとしていた。そんな時、ザフトの新型ガンダム3機が、地球連合の特殊部隊に強奪されてしまい…。PHASE-01〜13までで構成された『ガンダムSEED DESTINY』再編集の第1弾。