名作ＳＦ『猿の惑星』前日譚三部作の最終章。人類を率いる“大佐”に家族を殺された猿のリーダー、シーザーが復讐の旅に出る。■猿と人類の全面戦争が始まって２年。猿たちのリーダー、シーザーは、人類の軍隊を率いる“大佐”の奇襲を受け、愛する妻と息子を失ってしまう。憎しみに駆られたシーザーは、群れを新たなアジトへ移動させる一方で、わずかな仲間を連れて復讐の旅に出る。道中、口のきけない人間の少女ノバや人間から物資を盗んで暮らすチンパンジーのバッド・エイプと出会ったシーザー一行は、やがて大佐が指揮する巨大な要塞に辿り着くが…。